微生物与人类健康息息相关，人体内微生物大部分在肠道中，约占微生物总重量的80%以上。肠道中许多微生物是有益的细菌，也就是通俗意义上所讲的益生菌，例如乳酸菌，双歧杆菌，在消化吸收、免疫反应、代谢活性方面发挥着重要作用。一旦肠道菌群受到干扰或者失衡则影响身体健康，冠心病、糖尿病等慢性疾病都与肠道菌群存在关联。科学研究发现通过改善肠道菌群特别是益生菌的方式可以调理冠心病、糖尿病等慢病。
益生菌疗法对抗冠心病冠心病是由心脏中的冠状动脉粥样硬化引起的。冠状动脉内壁的加厚被称为"动脉硬化"，当一个人的血液中含有较高的胆固醇含量时，通常会发生动脉硬化。
使用益生菌可以控制胆固醇，益生菌疗法不仅可以降低胆固醇，还可以降低血压。食用某些乳杆菌或其他代谢物制成的产品，可降低血压，并可作为病人控制血压偏高的工具。
益生菌可以调理糖尿病糖尿病已成为肿瘤和心脑血管疾病之后，威胁人类生命健康的第三大杀手，会造成体内胰岛素减少或者胰岛素利用不充分而引起高血糖。糖尿病分两种，Ⅰ型糖尿病（或称胰岛素依赖型糖尿病）和Ⅱ型糖尿病（或称非胰岛素依赖型糖尿病）。对于患有Ⅱ型糖尿病的人来说，除常规疗法外，益生菌疗法作为新方式受到越来越多