导语:年底,我国武汉市陆续出现病因不明的群体性肺炎事件。通过对三名肺炎患者支气管肺泡灌洗液进行培养、直接聚合酶链反应以及全基因组测序证实致病源为一种全新未知新型冠状病毒。后被世界卫生组织正式命名为严重急性呼吸综合征冠状病毒2由此引起的肺炎称为新型冠状病毒肺炎。
一、了解新型冠状病毒肺炎,及时有效地对流感和新冠进行诊断十分关键
1、流行病学
过去的几十年,曾发生过两次全球/区域性的高致病性冠状病毒疫情。一次是严重急性呼吸综合征,于年11月在中国南方出现,SARS-CoV起源于马蹄蝠,经由果子狸传播到人。在37个国家造成了多例人类感染和例死亡,死亡率约为10%。另一次中东呼吸综合征,MERS-CoV起源于蝙蝠,通过单峰骆驼传播到人。
在沙特阿拉伯(年)和韩国(年)造成了两次暴发性疫情,全球确诊病例超过2,例,死亡率约为35%。SARS-CoV-2由于和年的SARS一样来自于野生动物市场,因此最初怀疑该病毒来自于蝙蝠,研究表明其平均传染系数R0为3.28,中位数为2.79,具有高度传染性。
由于全球范围内感染人数短期内急剧增高,3月11日WHO宣布新冠全球大流行,世界经济和医疗卫生系统受到巨大挑战。面对一种未知的传染病,综合各方面的临床大数据,包括流行病学特征、致病机制以及临床特征,汇总多维度数据进行综合研判对疫情防控及疾病诊疗至关重要。
2、临床表现
COVID-19患者临床表现形式多样,可表现为发热、咳嗽、咳痰、肌痛、疲惫等常见的普通症状;重症患者多在发病一周后出现呼吸困难和/或低氧血症,严重者可快速进展为急性呼吸窘迫综合征、呼吸衰竭、脓毒血症等严重并发症。新冠患者主要分为轻型、普通型、重型以及危重型四个类型。
(1)轻型主要为:临床症状轻微,影像学未见肺炎表现。普通型主要为:具有发热、呼吸道等症状,影像学可见肺炎表现。重型主要为:出现气促,RR≥次/分;静息状态下,指氧饱和度≤93%;PaO2/FiO2≤mmHg;肺部影像学显示24-48小时内病灶明显进展>50%者。
(2)危重型主要为:出现呼吸衰竭,且需要机械通气;出现休克;合并其他器官功能衰竭需ICU监护治疗。80%左右的COVID-19患者为轻型和普通型,临床症状无特异性,常表现为发热、咳嗽等。
流感是秋冬季最常见的呼吸道传染性疾病。除了发病时间重叠、临床症状相似,流感病毒还具有与COVID-19相似的传播特征,包括直接接触传播和通过空气飞沫传播;但两者疾病发展和临床结局大不相同。
在可预见的未来,COVID-19和流感病毒可能共同流行,及时有效地对流感和新冠进行鉴别诊断十分关键。大约25%的COVID-19患者有慢性基础性疾病,最常见的慢性病包括高血压,糖尿病,心血管疾病,慢性肺部疾病,慢性肾脏疾病,恶性肿瘤和慢性肝病。
住院患者最常见的症状是发烧,干咳,气短或呼吸困难,疲劳,恶心呕吐,腹泻,肌痛;同时也呈现一些非典型症状,如头痛、纳差及咽喉痛等。64%至80%的患者出现嗅觉和味觉功能障碍;3%的患者唯一症状是嗅觉或味觉丧失。
3、发热
发热是预测模型的标志物之一;与流感患者相比,COVID-19感染患者更容易发热。根据研究,约一半左右的COVID-19患者在感染初期即出现发热,而87.9%的住院患者均有发热表现。我们推测,由于大多数COVID-19患者年龄较大,且存在高血压、糖尿病等常见的慢性基础性疾病,SARS-CoV-2感染后病毒在体内快速大量复制激活免疫系统随即出现发热现象。
同时,COVID-19患者早期出现白细胞减少是SARS-CoV-2感染的特征,有研究表示SARS-CoV-2可感染包括T淋巴细胞、单核细胞、巨噬细胞在内的免疫细胞,并诱导细胞死亡;而T细胞应答可抑制先天免疫的过度激活,免疫细胞大量消耗促进了细胞因子风暴的产生。
二、如何诊断新型冠状病毒肺炎?血清抗体检测属于相对快速的筛选方法
目前,COVID-19诊断方法主要有病毒核酸检测,抗原抗体检测以及二代基因测序。由于反转录-聚合酶链式反应具有直接测量病毒基因组的能力,因此是SARS-CoV-2检测的金标准。SARS-CoV-2的RT-PCR检测极限是10拷贝/反应,能检测低病毒滴度。
1、RT-PCR试剂盒
RT-PCR试剂盒的敏感性在80%之间,病毒RNA序列的变异以及取样程序不规范是导致结果不准确是主要原因。同时,为克服RT-PCR耗时长和成本高的问题,开发逆转录环介导的等温扩增(RT-LAMP)检测技术,该系统通过颜色的变化读出扩增反应,敏感性为97.6%,可在30分钟内判定结果。
2、血清抗体检测
血清抗体检测是一种相对快速的筛选方法,抗体检测主要包括IgM和IgG。研究表明酶联免疫吸附法(ELISA)在SARS-CoV-2发病5天后可以检测到IgM和IgG。IgM/IgG组合胶体金免疫层析法在疾病早期(发病后1-7天),中期(发病后8-14天)和晚期(超过15天),检测敏感性分别为11.1%,92.9%和96.8%。
侧向免疫层析检测(LFICS)已在中国开发并批准用于诊断COVID-19,作为一种即时诊断工具,可在15分钟内同时检测出SARS-CoV-2病毒的IgM和IgG抗体。LFICS分析的灵敏度为88.66%,特异性为90.63%。核酸和抗体的组合检测可将诊断灵敏度提高到99.4%。
同时,有研究对比ELISA和胶体金免疫法对IgM和IgG的检测效果,结果表明ELISA和胶体金免疫法联合检测IgM-IgG的灵敏度分别为87.3%(55/63)和82.4%(75/91)。两种方法的特异性均为%,提示ELISA和胶体金免疫层析法之间没有明显的区别。
3、二代测序技术
二代测序技术可对SARS-CoV-2基因组的约30个核苷酸进行完整测序。它为SARS-CoV-2的鉴定、变异检测等提供了高效准确的方法,同时也为菌株起源和病毒进化提供了思路。每个序列都被存入GISAIDEpiCoVTM数据库,迄今为止,全球NGS工作中有超过17个SARS-CoV-2序列。
结语:鉴于COVID-19是一种新发的具有高度传染性的疾病,死亡患者众多,深入分析死亡病例的流行病学特征,临床特征及治疗措施,探索死亡危险因素以及不同治疗措施对患者生存时间的影响;有利于帮助临床医生早期识别预后不良的患者,采取合适的治疗方式,提高患者生存率。