冠心病

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基于网络药理学和生物信息学的丹参酮IIA [复制链接]

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摘要:目的基于网络药理学和生物信息学方法分析丹参酮ⅡA治疗冠心病(CHD)的分子生物学机制。方法利用PharmMapper数据库筛选出丹参酮ⅡA的作用靶点,利用OMIM、GeneCards、CTD数据库筛选CHD疾病作用相关靶点。利用STRING数据库进行蛋白互作网络分析,利用Cytoscape构建蛋白相互作用网络,利用ClueGO插件进行GO分析和KEGG信号通路富集分析,利用Systemsdock数据库进行系统分子对接,利用iGEMDOCK软件进行分子对接来预测丹参酮ⅡA对CHD作用靶点的结合性。结果筛选出丹参酮ⅡA的潜在靶点个;与CHD相关的靶点42个;信号通路49条。结论丹参酮ⅡA治疗CHD具有多靶点、多通路作用的特点;其可能作用机制是通过调控CHD发展过程中的血压调节、细胞代谢、血管新生、内分泌、活性氧代谢等过程对CHD进行干预。

冠状动脉粥样硬化性心脏病简称冠心病(CHD),是指由于冠状动脉粥样硬化使管腔狭窄或闭塞导致心肌缺血、缺氧或坏死而引发的心脏病[1]。根据《中国心血管病报告》,年中国城市和农村居民CHD死亡率继续年以来的上升趋势,农村地区CHD死亡率明显上升。城市CHD发病率高于农村,城市地区下降趋势明显,农村地区呈上升趋势[2]。

丹参酮IIA是丹参的主要药效成分之一,具有对血管、血流的双重调节作用,能够减少血管内膜的增生,提高组织血流灌注、改善肾脏的微循环[3],但其作用分子作用机制尚不明确。网络药理学及生物信息学的建立,使得研究中药的潜在成分及其作用基因靶点具有了可用的研究策略[4-7]。本研究通过对丹参酮IIA中作用靶点和CHD相关的疾病靶点进行筛选汇总,得出丹参酮IIA作用于CHD的作用交联靶基因,并且进行生物信息学分析得到丹参酮IIA分子作用机制。

1材料与方法

1.1丹参酮IIA化学成分靶点预测

使用TCMSP数据库(

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